纳米孔测序仪 - 广州隆泽生物科技有限公司

您当前位置:首页产品中心蛋白基因第三代测序仪

产品中心

产品名称：

纳米孔测序仪

产品简介：

纳米孔链测序法

NANOPORE STRAND SEQUENCING

通过电场力驱动单链核酸分子穿过纳米尺寸的蛋白孔道，由于不同的碱基通过纳米孔道时产生了不同阻断程度的电流信号，由此可根据电流信号识别每条核酸分子上的碱基信息，从而实现对单链核酸分子的测序。

核心技术优势

KEY TECHNICAL ADVANTAGES

蛋白工程

完整的蛋白设计、测试和优化体系，可完成从基因改造到蛋白表征全流程研发

生物芯片

可拆卸的生物芯片，无需凑样，即用即测，耗材不包含电路，可有效降低测序成本

ASIC芯片

自主知识产权，国产化生产，全流程自主可控，中高通量芯片将实现单芯片同时检测数千个纳米孔

测序算法

创新的人工智能算法，兼顾速度和精度，满足客户对于测序效率与准确率的不同需求

产品性能
产品优势
产品视频
产品应用

QNome-3841

便携式纳米孔基因测序仪

实时、便携的长读长测序设备

让基因测序走进更多使用场景

QNome-3841hex

桌面式纳米孔基因测序仪

通量灵活的长读长测序设备

可同时运行6张芯片

特点

FEATURES

直接测序

小巧便携

成本低

长读长

速度快

操作精简

型号对比

MODEL COMPARISON

QNome-3841

QNome-3841hex

原理

纳米孔测序技术

应用类型

全基因组测序、靶向测序、宏基因组测序等

样本类型

DNA、cDNA 等

主机质保

3年

产地

中国

环境要求

存储温度

10 ~ 30°C

存储湿度

10% ~ 80%

工作温度

10 ~ 25°C

工作湿度

35% ~ 80%，无凝结

工作电源

12VDC, 20W

100-240VAC (50/60Hz)，120W

仪器外观参数

测序芯片

1个

6个

体积

122mm * 126mm * 48 mm

400mm * 321mm * 120mm

重量

0.8kg

10kg

芯片结构

可拆卸式芯片，不含电路

测序仪结构

内置专用集成电路

性能参数

测序速度

350 ~ 450bp/s (DNA，不同试剂)

运行时间

1min ~ 48h (可控)

运行数

1个独立测序实验

6个独立测序实验

获取序列时间

运行≥1min、实时

最大读长

>2Mb

数据产量

3Gb

（结合理论通量及实测表现所得）

18Gb

（结合理论通量及实测表现所得）

准确率

单次测序90%以上，一致性准确率99.9%以上

最大测序通道数

384个

2304个

代际优势对比

GENERATIONAL COMPARISON

纳米孔基因测序

Mb级长读长

纳米孔测序可以实现超长的读长，大大降低了后期基因组组装的难度，并易于实现对大尺度结构变异的检测。

目标核酸直接测序，有更多的未来应用可能性

纳米孔测序技术可以直接对DNA/RNA进行检测，无需PCR，未来还具备甲基化检测、蛋白质测序的潜力。

文库制备简单高效，支持实时碱基识别

纳米孔测序的文库制备过程简单高效，并且可以快速、实时的输出测序结果，运行时间短，获得足够数据后可随时停止。

便携式仪器，支持现场测序

纳米孔测序仪小型便携，操作简单，可以将基因测序的应用场景从专业化的实验室拓展到更加灵活丰富的现场环境当中。

单次运行成本低，无需凑样

纳米孔基因测序是更加经济有效的测序方法，单次运行成本低，极大降低测序设备的使用门槛。

传统短读长测序

读长通常为75-300 bp

读长较短，限制了基因组组装的质量，无法发现基因组中大尺度的结构变异。

样本需要前期处理过程，工作流程繁琐

通常需要额外的前期样本处理过程，增加测序时间及成本。

文库制备时间长，测序过程不能提前终止

需要较长的时间进行文库的制备，测序流程时间长，且无法应对测序过程中可能出现的意外中断。

设备体积庞大，应用于专门的测序场景

传统测序仪器体积庞大，移动及运输不便，使用环境受到极大限制，适合于测序中心一类的测序场景。

设备价格昂贵，开机成本高

传统大型基因测序设备价格昂贵，开机运行成本高，且需要专人操作，使用门槛高。

微生物是地球上最丰度和多样的生命体，在生态环境、人类健康、工业制造方面都发挥着关键作用。研究或鉴定微生物，有利于了解微生物的功能，解析微生物与疾病的关系，甚至改造微生物以应用于健康、工业、环保等各个方向。

齐碳科技纳米孔基因测序仪，支持直接对原始DNA模板进行无扩增、无偏好的测序，支持cDNA测序，支持短片段与长片段DNA测序。使用齐碳科技长片段纳米孔测序技术探索微生物的秘密，您可以做到：

微生物基因组组装

MICROBIAL GENOME ASSEMBLY

纳米孔基因测序读长长，更容易覆盖复杂区域和结构变异区域，且获得的长片段之间可以有更多的交叉重叠区域，更有利于组装获取正确的碱基顺序，得到短片段测序难以组装的重复序列等的准确序列，便于组装获得更完整的微生物基因组或完整的质粒，对其中的耐药、毒力等相关功能元件进行精细化的构成分析。

案例一

案例二

案例三

微生物基因组重测序

MICROBIAL WHOLE GENOME RESEQUENCING

利用长片段测序技术分析微生物基因组，可同时鉴定单核苷酸多态性位点（SNP，Single Nucleotide Polymorphism）、插入缺失位点（InDel，Insertion/Deletion）以及结构变异等信息，全面综合的获得微生物基因组突变信息，更有利于开展物种进化、种群特征、选择压力、水平基因转移等研究。

微生物多样性研究

MICROBIAL DIVERSITY RESEARCH

利用扩增子测序研究环境微生物多样性时，长片段测序可覆盖全长的保守区及可变区的序列（例如16S rRNA、18S rRNA、ITS等），更有利于微生物物种的精确识别及种水平的分类鉴定，从而更准确地研究物种组成与环境之间的关系。

新的应用或方法开发

NEW APPLICATION OR METHOD DEVELOPMENT

由于纳米孔基因测序技术具有无需片段扩增、测序片段长、测序速度快、仪器小巧便携、成本投入低等优势，且技术目前仍处于快速发展和进步的阶段，未来具有无限的应用潜力和发展空间，所以何不考虑快人一步，开始基于齐碳纳米孔测序平台进行新的应用或者方法的开发呢？

人类基因组计划（HGP）的完成，让人们第一次全面阅读了刻在人类DNA上的古老生命语言，为通过DNA测序来了解人类和个体奠定了基础。迄今为止，人类基因组序列仍未完全解析，围绕中心法则探索基因编码的秘密，仍是前仆后继的科学家们的使命与愿望。

齐碳科技纳米孔基因测序仪，支持直接对原始DNA模板进行无扩增、无偏好的测序，支持cDNA测序，支持短片段与长片段DNA测序。使用齐碳科技纳米孔基因测序技术探索基因编码的秘密，您可以做到：

SNP/InDel鉴定

SNP/InDel DETECTION

单核苷酸多态性位点（SNP）和插入缺失位点（InDel）与众多类型的肿瘤和遗传病直接相关，也是祖源信息、特定表型信息等人类地理或表型特征具有代表性的标志物，SNP/InDel检测广泛应用于遗传病和肿瘤研究、人群研究、法医身份信息鉴定等多场景。使用纳米孔测序鉴定人类基因组SNP/InDel，探索与挖掘更多SNP/InDel与疾病和表型关联的可能性。

查看案例

结构变异鉴定

STRUCTURAL VARIATION DETECTION

结构变异一般超过50bp，类型包括缺失、重复、倒位、易位与复杂重组等，其类型和大小极其多样化，已有研究表明，结构变异与多种人类疾病相关，如癌症、自闭症、阿尔茨海默症等。据全基因组泛癌分析（PCAWG）联盟进行的迄今为止最全面的癌症基因组荟萃分析显示，17.8%的肿瘤存在复杂染色体重排，22.3%的肿瘤存在染色体碎裂，准确的鉴定结构变异对于进一步了解基因组的特征、诊断或治疗相关疾病至关重要。传统测序技术由于读长较短的限制，分析结构变异存在大量的假阳性和假阴性，因而结构变异的研究仍处于初级阶段。使用纳米孔长片段测序技术，更全面准确地解析复杂区域信息，挖掘结构变异的价值。

目标片段单体型分型

HAPLOTYPE PHASING OF THE TARGET REGION

单体型是基因组上紧密连锁的一段区域，一般不发生重组，倾向整体遗传给后代。获得个体目标区域单体型信息，有利于解析遗传突变来源（比如明确携带复合杂合突变的个体，其两个突变是分别来自父母还是来源于同一个人），研究人群单体型组成，将极大推动疾病分子机制解析和临床诊断与治疗。传统测序技术分析单体型一般是通过人群频率计算或者短片段组装的方法，具有复杂度高和准确性差的短板。使用纳米孔长片段测序技术，更轻松的获得目标区域的单体型信息。

转录组研究

TRANSCRIPTOME RESEARCH

差异基因表达、mRNA可变剪切、融合基因的表达情况等直接与疾病相关。过去的十几年里，传统RNA测序技术已经成了转录组研究不可或缺的工具，但传统测序技术在鉴定全长转录本以及mRNA可变剪切产生的不同isoform时，由于片段较短的限制（特别是在不同基因具有相似序列信息时），难以获得全面准确的信息。使用纳米孔长片段测序技术，更全面准确地获得全长转录本与不同isoform的信息，与单细胞测序技术联合应用也可获得单细胞水平转录本特征。

动物基因组组装

ANIMAL GENOME ASSEMBLY

构建完整的大基因组组装难度极大，尤其是针对重复序列及复杂区域。通过纳米孔基因测序可以更容易覆盖复杂区域和结构变异区域，且获得的长片段之间可以有更多的交叉重叠区域，有利于快速组装获取正确的碱基顺序，得到短片段测序难以组装的重复序列等的准确序列，同时实现单核苷酸变异（SNV，Single Nucleotide Variant）的单倍体分型、结构变异及重复区域的表征。

动物基因组重测序

ANIMAL GENOME RESEQUENCING

基因组重测序是对已知基因组序列的动物物种进行测序，并在此基础上完成个体或群体分析。通过对该物种的不同个体或同一个体的不同组织进行基因组重测序，可从群体或个体水平全面挖掘基因组序列差异。相较于传统二代测序，纳米孔基因测序技术具有长读长优势，理论读长可达Mb级，可轻松跨越大部分重复序列区域或者杂合区域，通过序列比对，可以找到大量的单核苷酸多态性位点（SNP），插入缺失位点（InDel）、结构变异位点（SV，Structure Variation）和拷贝数变异位点（CNV，Copy Number Variation)。通过生物信息手段，进一步分析不同个体基因组间的结构差异，同时完成注释，实现遗传进化分析及重要性状候选基因预测。

动物转录组研究

ANIMAL TRANSCRIPTOME RESEARCH

研究动物在进化、生长发育、免疫应答等方面的转录组信息，有助于理解动物各种生命活动规律的分子机制以及内在联系，获得的相应研究结果，在育种、抗病筛选、药物筛选、物种资源保护以及解决发育和进化相关生物问题等方面具有重要价值。使用纳米孔长片段测序技术，更有利于提升复杂基因的覆盖度、获得完整准确的基因表达数据与结构信息。

自第一个植物基因组——拟南芥基因组序列（2000年12月14日发表于《自然》杂志上）完成，已经过去20余年。在基因测序技术的不断进步下，截至2020年底，已累计发表1000多个植物基因组序列，代表了788个具有高度多样性的不同物种。这些植物基因组序列的可用性，特别是高质量的植物基因组序列，极大促进了对各种植物物种的植物生物学研究，尤其体现在功能基因组学和群体遗传学方面。

齐碳科技纳米孔基因测序仪长读长的优势，能够帮助更加准确地对大型且高度重复的植物基因组进行组装，更容易覆盖复杂区域，进一步解决结构变异等，为分子育种、遗传关系、进化过程的研究提供新思路：

植物基因组组装

PLANT GENOME ASSEMBLY

2000-2010年间，基因组测序的主要目标是为模型植物和作物提供高质量的参考基因组。尽管全球的科学家们已解码了788个物种的遗传信息，但这仅仅代表了绿色植物多样性的一小部分。构建近乎完整的基因组、组装复杂基因组以及构建参考泛基因组是未来植物基因组测序中最大的挑战之一。通过纳米孔基因测序可以更容易覆盖复杂区域和结构变异区域，且获得的长片段之间可以有更多的交叉重叠区域，有利于快速组装获取正确的碱基顺序，得到短片段测序难以组装的重复序列等的准确序列，同时实现单核苷酸变异（SNV）的单倍体分型、结构变异及重复区域的表征。

植物基因组重测序

PLANT GENOME RESEQUENCING

基因组重测序是对已知基因组序列的植物物种进行测序，并在此基础上完成个体或群体分析。通过对该物种的不同个体或同一个体的不同组织进行基因组重测序，可从群体或个体水平全面挖掘基因组序列差异。由于植物的多倍性，往往基因组较大且结构变异巨大，相较于传统二代测序，纳米孔基因测序技术发挥长读长的优势，能够轻松跨越结构变异断点，同时对基因组覆盖更加完整均一，利用全基因组重测序技术有助于快速发现与植物重要性状相关的遗传变异，应用于分子育种中，缩短育种周期。

植物转录组研究

PLANT TRANSCRIPTOME RESEARCH

从转录组水平研究植物基因功能以及特定的生理学过程，可挖掘基因功能、了解植物发育机制、了解次生代谢产物合成途径、开发分子标记等，可在挖掘植物功能基因、改良与培训新品种、环境保护等多方面发挥重要作用。使用纳米孔长片段测序技术，更有利于提升复杂基因的覆盖度、获得完整准确的基因表达数据与结构信息。

使用基因测序技术检测疾病相关生物标记、探索或确定基因与疾病的关系，已经成为了许多临床单位或检验机构的常规技术手段，广泛应用于产前筛查、遗传病携带筛查或诊断、肿瘤伴随诊断、药物敏感性检测、感染病原鉴定与用药指导等各个方向。

齐碳科技纳米孔基因测序仪，支持直接对原始DNA模板进行无扩增无偏好的测序，支持cDNA测序，支持短片段与长片段DNA测序，除了常规的SNP/InDel鉴定外，更有利于长片段复杂区域鉴定，比如利用长片段优势进行结构变异鉴定、病原鉴定等。另外，纳米孔基因测序仪设备小巧便携的特性，可广泛应用于各地方单位实验室，而通量灵活无需凑样检测、实时测序的特点，则非常适合需要快速获取测序结果的医疗单位和检测机构。使用纳米孔测序仪探索其应用于临床诊断的性能与优势：

遗传病研究

GENETIC DISEASE RESEARCH

纳米孔基因测序可同时鉴定遗传病相关的SNP、InDel、STR、结构变异等信息，综合获取患者遗传突变信息，更有益于便捷全面的疾病诊断和遗传携带筛查等。长读长的特点在鉴定复杂长片段序列信息，比如STR、结构变异、单体型分型场景，更具应用优势。

肿瘤研究

TUMOR RESEARCH

纳米孔基因测序可同时鉴定肿瘤相关的SNP、InDel、融合基因、复杂重排等信息，还可以基于长片段序列鉴定基因表达差异和isoform信息，全面综合地获取患者的突变、肿瘤突变负荷或表达信息，更有利于患者的用药与治疗，提升患者生存率等。长读长的特点在鉴定复杂长片段序列信息，比如结构变异、复杂重排、HLA分型等单体型分型场景，更具应用优势。

查看案例

感染性疾病研究

INFECTIOUS DISEASE RESEARCH

针对感染性样本，基于宏基因组或靶向富集的核酸文库的长片段测序，可获得更长的病原基因组序列信息，有利于提升病原物种鉴定能力，并有效检测耐药基因和毒力基因等，进而准确诊断患者感染类型。通过实时测序与数据分析，更有利于危重感染患者及时获得检测结果，便于及早进行治疗介入，提升患者生存率和降低治疗成本。

查看案例